剧情：
小智和皮卡丘等一行伙伴在 旅途中前行 。某日，宝 可梦波尔凯尼恩从天而降 并被迫与小智锁在了一起。波尔凯尼 恩与被人类伤害过的宝可梦 们共同生活，因此非常讨厌人类，但这条神奇 的锁链却让他们无法分开，奇妙 的故事就 此开始。小智与 皮卡丘又将一起开始新 的冒险……另一方面，在超级机关城市阿佐特 王国，大臣贾维斯得到了常年追求的终极发明——500年前诞生于阿 佐特王国 的人造宝可梦玛机雅 娜。据说在玛机雅娜 体内，有被称为“魂心”的未知力量，贪婪又邪 恶的贾维斯企图利用这股力量来 统治王国。小智和波尔凯尼恩将会如何化解彼此的嫌隙？波尔凯尼恩与玛机雅娜又有着怎样的渊源？他们要如何共同对 抗贾维斯拯救阿佐特王 国？玛机雅娜的最终命运又将如何结局？一场精灵宝可梦史上最伟大的战 役即将展开！ 想到那个神出鬼没的 东西，印颜的心又剧 烈跳动起来，“本来，昌长老感觉能按住 那条大尾巴， 可是，不知怎的，它突然又厉害起来，然后，那小冥兽，好像鬼魅一般，借着 地利，连着抹了 西才他们的脖子，昌长 老没办法，才完全放开了身 体的封印。”
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